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X11 Forwarding - Recieving X Output
Hello, I'm having an issue receiving X output from within Interactive jobs. I have confirmed that X output will return outside of a job. Submission Arguments: qsub -XI qsub -XI -l host=[exec host] xterm <return> ============================================ strace output points to an inability to write to localhost and/or…
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表示するジョブをソートするqselectについて。
この文章ではqselectの使用例をご紹介します。 qselectでは使用しているCPU、ユーザー、ジョブステータスなどを指定して表示することができます。 ただしqselectのみの使用ではjobIDのみ表示されます。 qstatやqdelとの併用が可能です。 qselectオプション例 -t <.OP.date-time> 特定の時刻、範囲 -l <resourcelist.OP.value> ジョブのリソースが指定範囲 -N <name> ジョブ名 -s <job states> ジョブステータス (R, Q, S, H, 他) -u <user_name> 特定のユーザ -x ジョブのステータスに関わらず、すべてのジョブ…
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PBS Professional jobIDについて
この文書ではPBS ProfessionalのjobIDが0へ戻る場合について説明します。 jobID(Job array ID)には最大値があり、その値になるとjobIDは0へ戻ります。 この最大値はデフォルトでは9999999ですが、 サーバー属性max_job_sequence_idで9999999～999999999999 の範囲で設定可能となっております。 もし重複したjobIDがqueue内に残っている場合、 例えばjobID"10"がキュー内に残存していた場合には、jobIDがmax_job_sequence_idを超えた後、jobIDは"0"へ戻り、…
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Execjob_abort hookについて
この文書ではPBS ProfessionalのhookであるExecjob_abort hookについて記載します。 PBS Pro version 2024 リリース時点において、Execjob_abort hookについてはPBS Professionalのマニュアルには記載されていません。 ただし、以下リンクで仕様について公開されております。 Execjob_abort hookについての詳細は以下リンクでご確認していただくようお願いいたします。 https://openpbs.atlassian.net/wiki/spaces/PD/pages/1063878670/Execjob_abort+hook
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Six questions about PBS Professional
PBSProfessionalについて以下6点質問がございます。 * キューの定義の仕方について キューの定義はコマンドで実行するのか、pbs.confを編集するのか、どちらで可能でしょうか。 * 予算管理について 予算管理ではどのような情報が収集できますでしょうか。 * 投入リクエストについて 投入リクエスト数に限度はございますか。 * データベースについて データベースの設定方法について教えていただけますでしょうか。 * システム構成について PBSではどのような冗長構成がとられるのでしょうか。 * コンテナの使用について コンテナを使用したシステムの事例等ございますか。
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PBS Professional 2024.1.1 is now available
Hello, I am pleased to announce that PBS Professional version 2024.1.1 is now available for customer download on the PBS User Area, Altair Connect, and Altair One Marketplace. PBS Pro 2024.1.1 is a bug fix release. The fixes include: HPCPBS-30619 Cgroup hook crashes if ANY process on the system has more than two spaces in…
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PBS Professional 2022.1.6 is Now Available
Hello, I am pleased to announce that PBS Professional version 2022.1.6 is now available for download on the PBS User Area and Altair Connect (Altair One Marketplace will be updated with the new version over night US time). PBS Pro 2022.1.6 is a bug fix release. The release includes the following important fixes:…
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Running Radioss-SPMD Job
Hello, I'm trying to get Radioss 2023.1 to work for us, but I get the following error message by submitting a Test tutorial via Access 2021.1.2 / pbspro 2021.1.4. (RHEL 7.9) start.py: INFO: Running command /cm/shared/apps/altair/2023.1/altair/scripts/radioss BIRD_WINDSHIELD_v1_0001.rad -onestep -mpi i -hostfile…
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PBS Professional 2022.1.5 Released
PBS Professional 2022.1.5 is now available for download in the User Area, Altair One Marketplace, and Altair Connect. This is a bug fix release that fixes 1 important issue: PBS-30192: Job which conflicts with top jobs/reservations can be run by scheduler if the last resource in the select statement requests 0, pushing out…
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PBS Professional 2024.1.0 Released
Hello, I am happy to announce that PBS Professional 2024.1.0 is now available! Software packages and documentation can be obtained via the PBS Professional User Area, Altair One Marketplace, and Altair Connect. PBS Professional 2024.1.0 contains many features and updates, including: GraphQL WebAPI Interface for job…
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How to run the job script on the Singularity container_?
Hi all, I deployed PBS pro(free demo) cluster with 2 host. * node138: altair license manager, server host, execution host * node139: execution host And installed Singularity on both node and I have confirmed it worked. [pbsdata@node139 ~]$ singularity exec /home/pbsdata/singularity_img/lolcow.sif cowsay moo _____ < moo >…
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How to get the system and user mode cputime of submitted jobs in PBSPro?
When I use "qstat -a" or "qstat -f", I can get the cputime information, but is it possible to get in detail about kernel and user mode cputime? Maybe I have to modify the "cgroup hook" script? Thank you.
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PBS Pro State down
I ran PBS Pro for the first time in a long time and it ended up being state:down. (Currently, if you restart it, it will become state: free and you can use it) Since the following logs existed, I suspect that there is a problem with the communication between the server and MoM. mom_log: 01/25/2024…
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PBS Pro Exit_status 262/267 cause
There are JOBS that end with an error. When I checked with the "qstat -xf" command, the Exit_status returned 262/267. What could be the cause of the Exit_status 262/267? The PBS version uses 19.2.6.
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New Video: SC23 CIQ booth presentation "The Difference Between Altair PBS Professional and OpenPBS"
Scott Campbell, Altair® PBS Professional™ product manager, highlights the differences and benefits of PBS Professional and OpenPBS® at the CIQ booth during SC23 https://www.youtube.com/watch?v=vYfTy-GYjDk
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Altair HPCWorks: A Comprehensive Solution for High-Performance Computing Management Over Open-Source Job Schedulers
Manjunath Doddam, Altair HPCWorks Senior Technical Specialist, has put together a great white paper that highlights the advantages of the Altair HPCWorks platform over OSS options. Thank you, Manju! The Altair® HPCWorks™ high-performance computing (HPC) and cloud platform offers a solution that’s superior to open-source…
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New Video: Introduction to Hooks in Altair® PBS Professional®
Altair PBS Professional has a unique customization architecture that allows administrators to install python hooks, triggered by events in the workload manager. There are many events to choose from, on both the server side and on the execution host, making it possible to tune PBS Professional to your exact needs. In this…
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PBSのファイル転送 stagein/stageout およびsandbox属性について
この文章ではPBS Professionalで使用するアプリケーションファイルの転送方法、 stagein/stageout job属性 (attribute)、sandbox属性等について解説します。 当文書では以下の4台で環境を構成している例を使用します。 pbs-head: 管理サーバ pbs_server,pbs_sched,pbs_commの各デーモンが稼働 node01: 計算ノード pbs_momデーモンが稼働、Optistructがインストールされている node02: 計算ノード pbs_momデーモンが稼働、Optistructがインストールされている front-end:…
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jobs being killed with this in the .e file "bash: line 1: 108753 Killed /cm/local/apps/pbspro/var/spool/mom_priv/jobs/964223.polaris.SC"
I submit 32 simple hello world batch jobs and 1/3 or more will die with the in the .e log bash: line 1: 108753 Killed /cm/local/apps/pbspro/var/spool/mom_priv/jobs/964223.polaris.SC All 32 jobs are identical #!/bin/bash #PBS -S /bin/bash #PBS -l select=1:ncpus=4:mem=12gb:host=p0314 #PBS -q admin #PBS -l place=shared #PBS…
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出力ファイルのサイズを制限するオプションとその注意点
PBS Professionalで実行するジョブのアウトプットファイルのサイズ制限を例を用いて説明します。 ---------------------------------------------------- 当文書では以下の3台で環境を構成している例を使用します。 pbs-head: pbs_server,pbs_sched,pbs_commの各デーモンが稼働。当例ではjobのsubmitもこのサーバで実施。 node01: pbs_momデーモンが稼働する計算ノード node02: pbs_momデーモンが稼働する計算ノード ---------------------------------------------------- *…
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Job_sort_fromulaを使ったJobの並び替え
この文書ではPBS Professionalのスケジューリングツールであるjob_sort_formulaを使ったジョブの並び替え・動作確認を例を用いて説明します。 ---------------------------------------------------- 当文書では以下の3台で環境を構成している例を使用します。 pbs-head: pbs_server,pbs_sched,pbs_commの各デーモンが稼働。当例ではjobのsubmitもこのサーバで実施。 node01: pbs_momデーモンが稼働する計算ノード node02: pbs_momデーモンが稼働する計算ノード…
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Altair Grid Engine および ALM (License Manager) 関連のドキュメント／モジュールのダウンロード
Altair Grid Engine および ALM (License Manager) 関連のドキュメント／モジュールは、Altair One よりダウンロードが可能です。 1. Altair One (https://altairone.com/Marketplace) にアクセスし、sign in します。 2. All Apps から Altair Grid Engine を選択します。 ＜Altair Grid Engine のマニュアル／モジュール＞ - Download を選択し、マニュアルは Documents で、モジュールは Suite Version および Operating System…
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PBS Professional および ALM (License Manager) 関連のドキュメント／モジュールのダウンロード
PBS Professional および ALM (License Manager) 関連のドキュメント／モジュールは、Altair One よりダウンロードが可能です。 1. Altair One (https://altairone.com/Marketplace) にアクセスし、sign in します。 2. All Apps から PBS Professional を選択します。 ＜PBS Pro 関連のマニュアル、トレーニングテキスト／モジュール＞ - Download を選択し、マニュアルまたはトレーニングテキストは Documents で、モジュールは Suite Version および Operating System…
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WindowsとLinux混在環境で確認されるエラーメッセージ
WindowsとLinux混在環境で確認されるエラーメッセージ Linux とWindowsの両方の実行ホストを含むPBSコンプレックスを実行している場合は、pbs_commを実行しているホスト上でsssdを設定し、Windowsドメインのユーザーがpbs_serverとsssdが実行されるLinuxホストにログインできるようにする必要があります。sssdが未設定や正しく設定されていない場合、以下のようなエラーメッセージが確認されます。 1 qstat等のコマンド実行時のエラーメッセージ Windows上のコマンドプロンプトからqstat等のコマンド実行時に以下のエラーメッセージが表示されます。 C:\Users\user01>qstat…
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pbsdsh and enviornment variable PBS_VNODENUM
The documentation I have been able to find on the usage of pbsdsh says that each instance of an executable spawned by pbsdsh will be given a unique environment variable PBS_VNODENUM, and that each instance can get its "identity" from that variable. I have tested pbsdsh on two different systems, and it looks like…