PBS Professionalで実行(qsub)したジョブのプロセス追跡方法
Shiratori Altair
Altair Employee
Altair EmployeePBS Professionalで実行(qsub)したジョブのプロセス追跡方法
ジョブプロセスの情報は、ジョブの属性であるSession ID、および、各計算ノードに作成される
<jobid>.<pbsサーバホスト名>.JBファイルの情報をprintjobコマンドで表示することによって確認できます。
以下、確認例です。
* 計算ノード上でプロセスを確認するにはroot権限で実施する必要がありますが、rootでコマンドを実行することを推奨するものではありません。
sudoなど必要なセキュリティ設定を実施することを推奨します。
1.ジョブのsession idと実行ノードを確認
[user01@pbs-head ~]$ qsub opt.sh
56.pbs-head
[user01@pbs-head ~]$ qstat -as 56
pbs-head:
Req'd Req'd Elap
Job ID Username Queue Jobname SessID NDS TSK Memory Time S Time
--------------- -------- -------- ---------- ------ --- --- ------ ----- - -----
56.pbs-head user01 workq OPTTEST 13219 1 2 -- -- R 00:00
Job run at Thu Sep 28 at 17:28 on (node01:ncpus=2)
[user01@pbs-head ~]$
* 上記"qstat -as <jobid>"のアウトプットの"SessID"列でsession idを確認、2列目のコメントで実行ノード名を確認します。
（上記例ではsession idが"13219"、実行ノードがnode01です。）
2.実行ノード上でsession idを元にした関連プロセスを確認
[root@node01 ~]# ps -g 13219
PID TTY TIME CMD
13219 ? 00:00:00 bash
13241 ? 00:00:00 56.pbs-head.SC
13242 ? 00:00:00 optistruct
13280 ? 00:00:00 tclsh8.5
13284 ? 00:00:11 optistruct_2022
13286 ? 00:00:00 radflex_2022_li
3.実行ノードが複数あるマルチノードジョブの場合は、各ノード毎に、$PBS_HOME/mom_priv/jobsディレクトリに存在する"<jobid>.pbs-head.JB"ファイルに対して printjobを実行しsidを確認します。
[root@node01 jobs]# pwd
/var/spool/pbs/mom_priv/jobs
[root@node01 jobs]# printjob 56.pbs-head.JB | grep sid
sid: 13219
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