HyperWorksインストールディレクトリ内の\io\translators\bin\win64\mdl_batch.batを使用します。
C:\Program Files\Altair\2017\io\translators\bin\win64\mdl_batch.bat aaa.mdl bbb.xml MOTIONSOLVE
でaaa.mdlを読み込み、bbb.xmlとしてエクスポートします。
ANALYSISを複数定義している場合は、
C:\Program Files\Altair\2017\io\translators\bin\win64\mdl_batch.bat aaa.mdl bbb.xml MOTIONSOLVE ANALYSIS:ALL
とすることで、bbb_ana_ccc.xml, bbb_ana_ddd.xml, などすべてのANALYSISに対応したxmlファイルをエクスポートできます。